生命情報学 キーノート

生命情報学 キーノート

著者名 D.R.ウェセッド・J.H.パリッシュ・R.M.トゥイマン
池尾一穂 監訳
鈴木善幸 監訳
五條堀 孝 監訳
発行元 丸善出版
発行年月日 2003年12月
判型 B5 257×182
ページ数 282ページ
ISBN 978-4-621-06463-4
ジャンル 生物・生命科学 >  シリーズ生物・生命科学 >  キーノートシリーズ

内容紹介

大学1〜2年の学生を対象としたバイオインフォマティクス(生命情報学)の入門書。生命情報学の基本的内容が52の項目に分けて記述。

目次

A.生命情報学の全体像
生命情報学の展望
生命情報学とインターネット
WWW上の役に立つ生命情報学サイト
B.データの獲得
DNA,RNA,タンパク質の配列決定
タンパク質構造の決定方法
遺伝子とタンパク質の発現情報
タンパク質相互作用データ
C.データベース 内容,構造,アノテーション
ファイル形式
アノテーションされた配列データベース
ゲノムや生物種に特化したデータベース
雑多なデータベース
D.生物学データの取得
EntrezとDBGET/LinkDBを用いたデータの取得
SRS(配列取得システム)を用いたデータの取得
E.配列類似性の基準によるデータベースの配列検索
配列の類似性検索
アミノ酸置換行列
データベース検索:FASTAとBLAST
配列の浄化
反復データベース検索とPSI-BLAST
F.多重配列アラインメント:遺伝子およびタンパク質ファミリー
多重配列アラインメントとファミリー関係
タンパク質ファミリーとパターンデータベース
タンパク質ドメインファミリー
G.系統学
系統学,分岐学,オントロジー
系統樹作成
高分子配列の進化
H.配列アノテーション
ゲノムアノテーションの原理
アノテーションツールと資源
I.構造情報学
概念モデルとタンパク質の立体構造
タンパク質三次元構造とタンパク質機能との関連
タンパク質の構造と機能の進化
構造データの入手,視覚化と解析
構造アラインメント
既知の三次元構造に基づくタンパク質の分類:CATHとSCOP
タンパク質の構造予測法入門
比較モデリング法による構造予測
二次構造予測
より進んだタンパク質の構造予測と予測戦略
J.マイクロアレイのデータ解析
マイクロアレイデータ:解析方法
マイクロアレイデータ:ツールと資源
配列サンプリングとSAGE
K.プロテオミクスデータ解析
二次元電気泳動のデータ解析
タンパク質の質量分析データの解析
L.高次システム
分子経路のモデル化と再構成
タンパク質相互作用の情報学
高次モデル
M.生物学における化学情報資源
分子表記の規則
化学情報学の資源
N.創薬産業における生命情報学
生命情報学と創薬
製薬情報学の資源
O.生命情報学における計算機処理の基本原理
コンピュータソフトウェアの実行
コンピュータオペレーティングシステム
ソフトウェアのダウンロードとインストール
データベースの操作

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